Aphanomyces euteiches

L’objectif du projet est de produire une collection d’ESTs d’Aphanomyces euteiches par séquençage 5’ de deux banques d’ADNc (10 000 lectures pour chaque) construites à partir d’ARNm de mycélium cultivé dans deux conditions différentes :

• la première banque (ayant fait l’objet d’un séquençage à une échelle pilote) correspond à du mycélium en phase stationnaire de croissance en milieu artificiel ;
• la seconde banque sera réalisée en condition précoce d’infection (agent pathogène au contact de racines de l’hôte Medicago truncatula).

Genoscope entreprend les étapes suivantes :

• A partir des bactéries transformées, 10 000 clones seront repiqués pour chacune des banques
• 20 000 lectures environ seront réalisées en 5’ sur séquenceurs ABI3730.

Contacts : Patrick Wincker (Genoscope) - Elodie Gaulin (Pôle de Biotechnologie Végétale Castanet-Tolosan)