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Acyrthosiphon pisum

Collection d’EST

Projet: Collaboratif
Etat du projet: Fini



Collaborations :

INRA-Rennes
UMR INRA-EMSA « Biologie des Organismes et des Populations appliquées à la Protection des Plantes »

INRA-Lyon
UMR BF21 « Biologie Fonctionnelle, Insectes et interactions »

Unité de recherche Génomique-Info/Génoplante-Info, Evry

Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva
Valence, Espagne

Department of Ecology & Evolutionnary Biology
Princeton University, USA

La nuisibilité des pucerons est double : blessure et affaiblissement des plantes par ponction de sève et transmission de maladies virales. Elle est due au mode de reproduction (alternance parthénogenèse/sexe), à la dispersion (migration par développement d’ailes), à l’adaptation trophique (choix de l’hôte, endosymbiose bactérienne obligatoire) et à la vection de virus (passage dans le tube digestif et les glandes salivaires). Ce projet vise à identifier sur une espèce unique, le Puceron du Pois (A. pisum), et par une approche transcriptomique à grande échelle, les gènes régulés lors de ces processus.

Le Genoscope entreprend le séquençage d’environ 35 000 EST sur des banques issues de différents organes du Puceron des Bois :

  • Tête (perception du photopériodisme régulant le mode de reproduction) : 10 000 EST
  • Antennes (perception de l’hote) : 5 000 EST
  • Glandes salivaires, tubes digestifs et bactériome (tissu mixte bactéries endosymbiotique/puceron) (adaptation trophique) : 5 000 - 10 000 et 5 000 EST

Des lectures simples en 5’ seront effectuées. Les banques étant non soustraites et non normalisées, après un premier tour de séquençage, ces séquences seront soustraites des banques initiales et un second tour de séquençage sera réalisé.

Résultats

Un projet de séquençage à grande échelle d’EST du puceron Acyrthosiphon pisum a été réalisé par l’INRA en collaboration avec le Genoscope. 40,904 ESTs ont été générées, représentant 12,082 transcrits uniques.

Contacts :
Patrick Wincker (Genoscope) - Denis Tagu (INRA)

mise à jour le 5 juin 2009

© Genoscope - Centre National de Séquençage
2 rue Gaston Crémieux CP5706 91057 Evry cedex
Tél:  (+33) 0 1 60 87 25 00
Fax: (+33) 0 1 60 87 25 14

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