Acinetobacter baumannii VEB et SDF

Le Genoscope entreprend le séquençage de deux souches d’Acinetobacter baumannii : une souche nosocomiale multirésistante aux antibiotiques (VEB) et une souche communautaire multisensible (SDF).

La taille du génome de chacune des deux souches est estimée à 4 Mb environ. Chaque génome sera séquencé à une profondeur de 12X, à partir de trois banques : 30 000 inserts de 3 kb clonés dans le vecteur pNAV (haut nombre de copies, vecteur navette entre E. coli et Acinetobacter), 11 500 inserts de 10 kb clonés dans le vecteur pCNS (bas nombre de copies) et près de 4 000 inserts de 20-25 kb clonés dans un vecteur miniBAC (pBBC).

Une étape de finition manuelle sera effectuée au Genoscope.

Contacts :
Valérie Barbe (Genoscope) - Didier Raoult, Catherine Robert (UMR 6020)