Marinobacter hydrocarbonoclasticus ATCC49840

Les Marinobacters appartiennent à un genre marin décrit en 1992 par le Centre d’Océanologie de Marseille. Ce genre semble ubiquiste dans les environnements marins puisque plusieurs souches ont été isolées ou détectées à partir de biotopes très diversifiés d’un point de vue géographique et physicochimique (tapis bactériens hypersalés, source marine d’eau chaude au Japon ou mers froides comme l’Arctique et l’Antarctique). La versabilité métabolique des Marinobacters leur permet d’utiliser comme source de carbone et d’énergie des substrats réputés récalcitrants à la dégradation comme les hydrocarbures et un grand nombre de publications analysent ces métabolismes originaux.

La souche type, Marinobacter hydrocarbonoclasticus, présente des caractéristiques physiologiques remarquables. Elle est capable de pousser sous forme planctonique libre ou fixée et de former des biofilms. Elle dégrade certains hydrocarbures. Elle est halotolérante extrême et produit un osmoprotectant, l’ecto&iauml;ne.
Comme un certain nombre de Marinobacters, elle est aérobie facultative et dénitrifiante. De plus, elle synthétise une phosphatase extracellulaire.

Le séquençage du génome de la souche type permettrait une meilleure compréhension des gènes impliqués dans l’assimilation des sources de carbones simples et labiles (OOB, Banyuls) ou récalcitrantes comme les hydrocarbures (LEM, Pau), dans le cycle de l’azote (LMGEM, Marseille), dans la synthèse d’enzymes extracellulaires (IBSM-Marseille), sur la formation de biofilm (LEM, Pau) ainsi que dans les mécanismes d’adaptation au sel (LMGEM, Marseille). Au travers de cette étude, une avancée majeure dans la connaissance des métabolismes fondamentaux d’un micro-organisme marin ubiquiste serait réalisée.